Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc170D3YXL0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc170D3YXL0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc170D3YXL0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms