Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga9B8JK39 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga9B8JK39 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga9B8JK39 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms