Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms