Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cped1B2RX70 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cped1B2RX70 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cped1B2RX70 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms