Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol7aB2RT54 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apol7aB2RT54 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Apol7aB2RT54 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apol7aB2RT54 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Apol7aB2RT54 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apol7aB2RT54 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apol7aB2RT54 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Apol7aB2RT54 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apol7aB2RT54 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apol7aB2RT54 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apol7aB2RT54 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apol7aB2RT54 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apol7aB2RT54 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms