Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik3B1AS29 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Grik3B1AS29 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik3B1AS29 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik3B1AS29 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms