Protein–RNA interactions for Protein: A6H6E9

Ttc23l, Tetratricopeptide repeat protein 23-like, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc23lA6H6E9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc23lA6H6E9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc23lA6H6E9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc23lA6H6E9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc23lA6H6E9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms