Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r232A2RTT5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn1r232A2RTT5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r232A2RTT5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms