Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtf1A2AQ19 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rtf1A2AQ19 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rtf1A2AQ19 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms