Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn1aA2APX8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scn1aA2APX8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms