Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C87977A2A958 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C87977A2A958 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C87977A2A958 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C87977A2A958 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C87977A2A958 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C87977A2A958 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C87977A2A958 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C87977A2A958 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C87977A2A958 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C87977A2A958 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C87977A2A958 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C87977A2A958 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C87977A2A958 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C87977A2A958 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C87977A2A958 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.5 ms