Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gm6268A2A3U9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Gm6268A2A3U9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm6268A2A3U9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms