Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fam71e1A1L3C1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fam71e1A1L3C1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Fam71e1A1L3C1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fam71e1A1L3C1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fam71e1A1L3C1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fam71e1A1L3C1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fam71e1A1L3C1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms