Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
1700019A02RikA0A087WPV9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
1700019A02RikA0A087WPV9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms