Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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