Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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