Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Hdac6Q9Z2V5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Hdac6Q9Z2V5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Hdac6Q9Z2V5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Hdac6Q9Z2V5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Hdac6Q9Z2V5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Hdac6Q9Z2V5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Hdac6Q9Z2V5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Hdac6Q9Z2V5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Hdac6Q9Z2V5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Hdac6Q9Z2V5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Hdac6Q9Z2V5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac6Q9Z2V5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms