Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms