Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3Q9Z2D8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms