Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Cldn6Q9Z262 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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