Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgr5Q9Z1P4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms