Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup160Q9Z0W3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms