Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn3Q9Z0G9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms