Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms