Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ5

Apip, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApipQ9WVQ5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ApipQ9WVQ5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApipQ9WVQ5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms