Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms