Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms