Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt71Q9R0H5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms