Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr54Q9R0D8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms