Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek3Q9R0A5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms