Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nphs1Q9QZS7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nphs1Q9QZS7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nphs1Q9QZS7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nphs1Q9QZS7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nphs1Q9QZS7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nphs1Q9QZS7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nphs1Q9QZS7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nphs1Q9QZS7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nphs1Q9QZS7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nphs1Q9QZS7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nphs1Q9QZS7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nphs1Q9QZS7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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