Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf4Q9QZS2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms