Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Npas3Q9QZQ0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms