Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms