Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms