Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pkp3Q9QY23 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pkp3Q9QY23 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pkp3Q9QY23 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pkp3Q9QY23 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pkp3Q9QY23 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pkp3Q9QY23 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pkp3Q9QY23 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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