Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms