Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms