Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms