Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PdcQ9QW08 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdcQ9QW08 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms