Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dkk3Q9QUN9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms