Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms