Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms