Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx5Q9JKQ4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms