Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms