Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms