Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms