Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ap3m1Q9JKC8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms