Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc86Q9JJ89 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc86Q9JJ89 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc86Q9JJ89 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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