Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1fQ9JIS7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms