Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms